Bilbao s'est dotée d'une importante infrastructure sanitaire couvrant les besoins des citoyens à travers le Servicio Vasco de Salud - Osakidetza (Service basque de santé), ou les centres de santé privés.

Pour les étrangers, il est indispensable d'avoir une couverture médicale à travers la réciprocité des systèmes de santé nationaux (E-128 ou Carte sanitaire européenne dans les pays de l´Union européenne, en plus du principauté de Liechtenstein, l' Islande, la Norvège et la Suisse) ou à travers des assurances privées. La E-128 ou Carte sanitaire européenne permet à son titulaire de se faire assigner un médecin généraliste et couvre toutes les urgences hospitalières dans des centres publiques